“幻影神奇宝贝都消失了！”小霞惊讶。
大木博士也快冲出门了，一只化石翼龙冲向博士。
“博士，危险啊！”
化石翼龙抓住了大木博士，众人担心。
小炫此时以极为不同寻常的速度冲向大木博士，抱住了大门博士想救下大木博士，可惜力气太小了，被化石翼龙一起带走了。
“大木博士！小炫！”众人担心道。
“我们去，皮卡丘！”小智冲向城堡，大家都跟着小智，准备就大木博士和小炫。
城堡门前又出现了许多幻影神奇宝贝，小智等人被阻在那了。
“那么，小孩的杂耍时间已经结束了。”神秘人走向城堡里，没有搭理小智了。
“大木博士，小炫，我一定会就你出来的。”小智一脸坚定。
城堡中，大木博士和小炫在房间里，被许多幻影神奇宝贝围住。
“小炫，不要害怕！”大木博士关心小炫一声，毕竟小炫还是个孩子。
“没事，小场面，又没有传说神奇宝贝，不害怕。”小炫一路淡然。
“额…”大木博士无语，现在的小孩都这么大胆们，他是不是跟不上时代了。
“欢迎来到荣格博士的研究实验室。”神秘人出现在两人面前。
“幻影主谋者，你把荣格怎么了，他没事吧？”大木博士向主谋者打探荣格的消息。
“你现在不过是阶下囚，没有资格向我发问。”主谋者回答道。
大木博士一脸愤怒，小炫一直平静的看着远处的事，他想看看大木博士多久会发现主谋者就是荣格博士。
“我希望你立刻给我大木博士研究所数据库的存取密码。”主谋者说出了自己的目的。
“密码，你到底想拿我的研究数据干什么？”大木博士质问道。
“我可以把数据用在非常好的地方，比你更有效的利用。”
“别做梦了，我拒绝提供任何信息给你这个来路不明的家伙。”大木博士一脸坚决。
“山梨研究所数据库的密码要吗？”小炫冷不丁的说了一句。
两人同时看向小炫。
“小炫！”大木博士想阻止小炫。
小炫拍了拍大木博士的手，示意他放心。
“放心，我要告诉他，他在白日做梦。”小炫大声的说出。
“我明白了，这都是些脾气暴躁的家伙，本来我打算温和的解决问题的。”主谋者威胁道。
“你以为这样的威胁就可以吓到我吗。”大木博士拿出了一个神奇宝贝球。
旁边的小炫似乎有意无意的拿出一个小相机，记录着眼前发生的一切。
一只大狼犬向大木博士怒吼，发现了大木博士的异常。
“放弃吧，现实中没有一只神奇宝贝可以跟幻影神奇宝贝相抗衡。那么快说出密码。”主谋者说出了一句自大的话。
“无知！自大！”小炫内心给荣格博士加上了四个字。小炫眼睛向四周不着痕迹的一瞄，发现了一只有趣的东西。
幻影神奇宝贝梦幻！
此时，外边的小智一行人已经开始了营救计划。
“大木博士，我认为神奇宝贝是一种有缺陷且脆弱的生物。”主谋者说道。
“比如岩石系的神奇宝贝大岩蛇经受不住水系的攻击，而水系的金鱼王又
操作装置的毁坏后，波士可多拉化为光芒消散了。
“消失了！”小智惊讶。
“荣格你还好吗？”大木博士扶起荣格。
“还好！”荣格站了起来。
小炫觉得好戏登场了，他要结束这场无聊的闹剧。
这时，地上的半圆形有发出光芒，许多神奇宝贝出现在众人面前。
“那是…刚才的幻影神奇宝贝！”
“这次化石翼龙也出现了！”众人惊讶，小炫的手拿着神奇宝贝球准备应对接下来的事情。
“可是怎么会？我的控制器坏掉了，这到底是怎么了？”荣格博士一脸不解。
“哈哈哈…”
“荣格博士，你的幻影系统现在已经是我的了。居然是幻影神奇宝贝只是一团数据，真是无知。”一个神秘人站在城墙上。神秘人身披披风，戴着面具，感觉很邪恶。
“什么！你是谁？”小智大叫。
“我的名字是幻影的主谋者。”神秘人回答。
“幻影的主谋者！”
“你想拿我的幻影系统做什么？”荣格博士问道。
“去吧，幻影神奇宝贝，让这群无知的人知道幻影神奇宝贝的厉害！”神秘人没有回答，而是命令幻影神奇宝贝们。
幻影神奇宝贝们冲向众人。
“我们不可能击退那么多幻影神奇宝贝的，大家快逃！”大木博士喊道。
两只化石翼龙冲向大木和荣格两位博士。
“去吧，皮卡丘，十万伏特！”小智派出皮卡丘阻挡化石翼龙。
皮卡丘释放出狂暴的电流，可是都被化石翼龙躲开了，并且一只化石翼龙抓住了荣格博士，带走了他。
“救我！”
“荣格！”大木博士大叫。
荣格博士被化石翼龙带到了神秘人身后的城堡中，没有了踪影。
幻影神奇宝贝们冲向众人，大木博士立马下达了决定。
“事已至此，已经没有其他办法了，大家先到外面去。”众人急忙向大木的方向跑去。
众人下了楼梯，向门跑去。
“幻影神奇宝贝只能在幻影系统里行动，所以不可能追到门外。”大木博士将自己知道的说了出来。
“没那么容易。”神秘人操纵装置。
幻影太古盔甲释放出影子球，击中了小胜，小胜倒在地上。
“小胜！”众人大惊。
大木博士扶起小胜继续跑。
神秘人又操作了装置，幻影神奇宝贝都去追小炫一行人，大木博士直接无视。
大木博士看到没有抓自己，立马向前追去。
“这样下去他们会抓到我们的。”
“大家，加油啊！马上到出口了！”
众人跑出了大门，紧追在后面的幻影神奇宝贝通过大门时，都消失了。
“幻影神奇宝贝都消失了！”小霞惊讶。
大木博士也快冲出门了，一只化石翼龙冲向博士。
“博士，危险啊！”
化石翼龙抓住了大木博士，众人担心。
小炫此时以极为不同寻常的速度冲向大木博士，抱住了大门博士想救下大木博士，可惜力气太小了，被化石翼龙一起带走了。
“大木博士！小炫！”众人担心道。
“我们去，皮卡丘！”小智冲向城堡，大家都跟着小智，准备就大木博士和小炫。
城堡门前又出现了许多幻影神奇宝贝，小智等人被阻在那了。
“那么，小孩的杂耍时间已经结束了。”神秘人走向城堡里，没有搭理小智了。
“大木博士，小炫，我一定会就你出来的。”小智一脸坚定。
城堡中，大木博士和小炫在房间里，被许多幻影神奇宝贝围住。
“小炫，不要害怕！”大木博士关心小炫一声，毕竟小炫还是个孩子。
“没事，小场面，又没有传说神奇宝贝，不害怕。”小炫一路淡然。
“额…”大木博士无语，现在的小孩都这么大胆们，他是不是跟不上时代了。
“欢迎来到荣格博士的研究实验室。”神秘人出现在两人面前。
“幻影主谋者，你把荣格怎么了，他没事吧？”大木博士向主谋者打探荣格的消息。
“你现在不过是阶下囚，没有资格向我发问。”主谋者回答道。
大木博士一脸愤怒，小炫一直平静的看着远处的事，他想看看大木博士多久会发现主谋者就是荣格博士。
“我希望你立刻给我大木博士研究所数据库的存取密码。”主谋者说出了自己的目的。
“密码，你到底想拿我的研究数据干什么？”大木博士质问道。
“我可以把数据用在非常好的地方，比你更有效的利用。”
“别做梦了，我拒绝提供任何信息给你这个来路不明的家伙。”大木博士一脸坚决。
“山梨研究所数据库的密码要吗？”小炫冷不丁的说了一句。
两人同时看向小炫。
“小炫！”大木博士想阻止小炫。
小炫拍了拍大木博士的手，示意他放心。
“放心，我要告诉他，他在白日做梦。”小炫大声的说出。
“我明白了，这都是些脾气暴躁的家伙，本来我打算温和的解决问题的。”主谋者威胁道。
“你以为这样的威胁就可以吓到我吗。”大木博士拿出了一个神奇宝贝球。
旁边的小炫似乎有意无意的拿出一个小相机，记录着眼前发生的一切。
一只大狼犬向大木博士怒吼，发现了大木博士的异常。
“放弃吧，现实中没有一只神奇宝贝可以跟幻影神奇宝贝相抗衡。那么快说出密码。”主谋者说出了一句自大的话。
“无知！自大！”小炫内心给荣格博士加上了四个字。小炫眼睛向四周不着痕迹的一瞄，发现了一只有趣的东西。
幻影神奇宝贝梦幻！
此时，外边的小智一行人已经开始了营救计划。
“大木博士，我认为神奇宝贝是一种有缺陷且脆弱的生物。”主谋者说道。
“比如岩石系的神奇宝贝大岩蛇经受不住水系的攻击，而水系的金鱼王又承受不了电系的攻击，但是如果我同这台设备的话，就能创造出一只面对任何攻击都无所畏惧的神奇宝贝，这不是一件很美妙的事情吗？”主谋者暴露出自己的野心，拿出了操作装置。
“是这样啊！这就是你一直要计划要做的事！”大木博士一脸震惊。
小炫的嘴角上扬，任何攻击都无所畏惧的神奇宝贝，早就有了，阿尔宙斯，可惜还在沉睡，石板没有集齐。
大木博士看向四周的幻影神奇宝贝，一脸温和道：“确实所有的神奇宝贝们都有不同的属性、长处和短处，但这并不是你所说的缺陷，而是个性！”
“即使在同种类的神奇宝贝之间，也会有他们个性上的差异，摧毁他们的个体特征，这个想法真是不可理喻。”
“神奇宝贝们是存在大自然中的生物，甚至可以说是他们代表了自然，你绝不可以破坏这种平衡。”
大木博士一阵慷慨激昂的讲话。小炫自顾自的鼓掌叫好，不过眼睛一直看着梦幻。
梦幻察觉到了小炫的目光，冲小炫笑了笑。
小炫一惊，这只梦幻有自己的意识，真是神奇。
“不愧是大木博士，真是一场有趣的神奇宝贝讲座啊！”主谋者感叹。
“但是，在你听过我绝妙的计划之后，也许会改变想法的。”主谋者对着控制台一阵操作。
一个巨大的玻璃罩中，闪过白光，仿佛要出现什么东西。
“这是…”大木博士不确定。
另一边，小智和小霞成功潜入城堡，遇到了火箭队，真是人生何处不相逢。
小智一行人身影出现在实验室的屏幕上。
“小智、小霞！”大木担心道。
“果然还是来了，让我好好利用吧。”主谋者操作装置，幻影神奇宝贝都消失了，梦幻的身影没有了遮挡物，出现在了面前。
“你又出现了啊！”主谋者好像早就知道梦幻的存在。
“难道…你是梦幻，是梦幻吧！”大木博士惊讶。
梦幻飞到大木博士身边，来回转悠，好像在表示友好。
“初次见面，我是大木。”大木博士向梦幻打招呼。
突然，一道雷电击中梦幻，梦幻倒在地上。
“啊！梦幻！”大木博士担心道。
小炫急忙抱起地上的梦幻，怒道：“你怎么可以这样对待他！”
“你干嘛突然下手这么狠！”大木博士怒道。
“这与你们无关，那梦幻纯粹是一件失败品，立刻给我消失。”主谋者看向梦幻。
在小炫怀中的梦幻，挣脱了小炫的怀抱，看了众人一眼就离开了。
“梦幻！”
屏幕中，火箭队被打飞，小智和小霞被幻影神奇宝贝抓住。
在押运的过程中，两人都逃走了，只有皮卡丘被捉了回来。
皮卡丘被放在一个仪器上面，主谋者一阵操作。
“幻影的主谋者，你要对皮卡丘做什么！”
“我正在从皮卡丘的记忆中取出神奇宝贝的资料，既然你不愿意将数据提供给我。”主谋者摸了摸装皮卡丘的仪器。
小智一行人救到了大木博士和小炫，众人逃离了城堡。
主谋者也追了出来，幻影超梦跟着。
众人感到压力山大，幻影超梦的实力太强大了，根本没有赢的可能。
其实山梨研究所的密码是山梨博士给小炫的，山梨博士有意让小炫继承他的衣钵，可是小炫干着干着就走人了，这件事就不了了之。
小炫看着荣格博士与超梦，平静的说：“荣格博士，你知道我为什么会给你山梨博士数据库的密码吗？”
“哦，为什么？”胜券在握的荣格博士，对于小炫的话起了兴趣。
“其实，我一开始就觉得你不对劲了，不过我想看看你究竟在做什么，能做到什么地步，可惜没有达到我想要的结果。”小炫一脸高深莫测。
“现在，这场闹剧该结束了。”
“路卡利欧！”小炫大喊。
场面瞬间寂静无声，小炫尴尬万分，如果头顶上再有几只乌鸦，小炫都没脸见人了。
“轰！”城堡中发出惊天巨响。
最后一系列事情之后，幻影装置被破坏，整个城堡一片大火，荣格博士消失在大火中。
在茵郁市击败了茵郁道馆的娜琪，获得了白羽徽章。打败了之后一路挑战了道馆与华丽大赛，除了对战四天王的源治，爆发出极限力量，除了沙奈朵没上，其他的三只都上了，之后的小炫机缘巧合下获得了一只火稚鸡，终于凑齐了向芳缘联盟挑战的六只神奇宝贝。
小炫继续旅行，然后参加了两次华丽大赛，获得两枚缎带勋章，可以参加华丽大型庆典。
在华丽大型庆典上险胜罗伯特，成为了顶尖协调训练家。
在彩幽大会中，一路奋战，不断战斗，击败哲也，拿到了冠军！
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