为指挥使，郎舅各掌一部。李显忠又娶了蒙哥帖木儿的妹妹为妻，建州两部的关系因此更加紧密。
此后，蒙哥帖木儿在宣德八年八月遭到野人女真部落的袭击，寡不敌众之下与其长子阿谷一同遇害；宣德九年，明宣宗任蒙哥帖木儿同母弟凡察为都督佥事，代理建州左卫事。正统二年，蒙哥帖木儿次子董山被授命为建州左卫指挥使，与其叔凡察共掌建州左卫。
正统七年二月，因董山、凡察叔侄之间矛盾严重、争斗不已，为平息纠纷，同时也为了削弱建州女真实力，明朝再将建州左卫一分为二，另设‘建州右卫‘，以凡察为建州右卫指挥使，董山则继续为新“建州左卫”的指挥使。此时，,建州卫迁至浑河上游的苏克素浒河流域居住，以赫图阿拉为主城。后来建州左卫在董山、凡察的率领下也迁到这里，居于佛阿拉城。建州左卫析出建州右卫后，两卫以青龙岭为界，各自驻守一边，‘建州三卫’至此全部建立。
成化三年，因为建州三卫首领李满住、董山、纳郎哈时常串联越边墙入寇，侵夺大明财物，明宪宗在忍无可忍之下，以征夷将军总兵官赵辅率军五万出边墙进剿建州女真三卫；九月，明军斩杀了建州卫指挥使、都督同知李满住及其子古纳哈，建州右卫指挥使、都督佥事纳郎哈一并被杀；建州左卫指挥使董山则被明军抓获，在押送途中因试图逃跑被杀，建州三卫被明军击杀者一千七百余人；这就是史书中所记载的“成化犁庭”。
李满住、董山、纳郎哈被明军诛杀后，在严密监视的前提下，明朝授予李满住之孙完者秃为建州卫指挥使、授予纳郎哈之叔阿哈达为建州右卫指挥使、授予董山长子脱罗为建州左卫指挥使。此后，建州左卫指挥使一职先后在脱罗、妥义谟兄弟之间传承；约在嘉靖元年至二十年之间，脱罗、妥义谟的之侄福满承袭父辈留下来的官职，继任建州左卫指挥使，然后将建州左卫主城从从佛阿拉迁至赫图阿拉，和建州卫同居一城。
福满有六个儿子，分别是：德世库、刘阐、索长阿、觉昌安、包朗阿、宝实。迁居到赫图阿拉前后，福满生下六个儿子，即德世库、刘阐、索长阿、觉昌安、包朗阿、宝实。诸子逐渐长大后，福满给六个儿子分别成家立业，协助他们每人建立一个城池，因福满六子分居于六处，所以建州左卫及爱新觉罗氏家族的势力也因此不断扩大。
约在嘉靖中后期，福满年老去世，其第三子索长阿、第四子觉昌安先后承袭了建州左卫指挥使的官职。觉昌安在任时，为自己的第四子塔克世请婚于时任建州右卫首领的王杲之女喜塔腊氏，又把自己的女儿嫁给了王杲的儿子阿台，以维护建州左卫的生存。
从嘉靖三十六年起，王杲不断出兵侵袭明朝边墙以内，先后杀明朝多位辽东镇守武将，侵扰辽东各城镇。而在王杲侵袭明朝边地的时候，觉昌安及其子塔克世为了建州左卫的利益和安全，也不得不依附王杲一同参与劫掠。但觉昌安在参与寇边时，又暗中与明军私下往来、传递信息，密报王杲的动向和入寇计划。
万历三年，鉴于王杲的入寇行为越来越猖狂，因此明辽东总兵李成梁奉命率辽东明军五万人，效法当年赵辅围剿李满住的方法，四路合围进逼王杲的建州右卫首城古勒寨。在明军大兵压境之下，王杲只能仓皇逃窜，投靠了海西女真哈达部首领王台；但王台设计擒获王杲并绑缚送交给明军，之后王杲被押送至京师处死。
失去了首领的建州右卫首城古勒寨被李成梁一举攻破，当时在城内的觉昌安与其子塔克世因事先从交好的明军将领处得到了消息，因此提前离开古勒寨，躲过了这场祸事。但王杲的两个外孙——塔克世和王杲之女喜塔腊氏的长子努尔哈赤、次子舒尔哈齐因为恰好在古勒寨探亲，所以没来得及离开，被明军俘获并几乎被杀。
后来，李成梁得知了努尔哈赤、舒尔哈齐二人是建州左卫指挥使觉昌安的孙子，而觉昌安向来亲明、并给明军传递消息，所以李成梁没为难这两个少年，便将他们收留在自己的府内做随侍及杂役，三年后，李成梁又将二人送还给了觉昌安和塔克世。
王杲被明军擒拿诛杀后，其子阿台从古勒寨逃脱，于明军撤军后回到建州右卫故地，并重建了古勒城、沙济城，阿台还誓言要和明军作战到底。阿台之妻是觉昌安的女儿，因此觉昌安在建州三卫内部的地位逐渐提升，建州左卫的势力也开始慢慢壮大。
万历六年，十九岁的努尔哈赤和十四岁的弟弟舒尔哈齐一起被李成梁遣送回建州左卫祖父和父亲身边；此时，努尔哈赤生母、塔克世正妻喜塔腊氏已经去世，塔克世又另外娶了哈达部首领王台的女儿那拉氏为继妻；那拉氏不待见非自己所生的努尔哈赤兄弟，时常在塔克世面前诋毁陷害兄弟二人，久而久之，塔克世也不再关照两个大儿子。
因此，努尔哈赤兄弟不得不被迫和父亲分家，独自生活，并只分得了少量家产。此后的努尔哈赤与弟弟以挖参、采山货等方式为生，养活自己，还常常到边墙内的抚顺等地和明朝军民互市，以贸易易货的手段来养活自己和家庭。
万历十一年，李成梁再次奉诏发兵讨伐建州右卫，以将阿台的势力给彻底消灭；当时，明军发兵进攻建州右卫的古勒城与沙济城，还以图伦城城主尼堪外兰为向导、包围阿台部。阿台的妻子是觉昌安的女儿，所以感觉女儿有危险的觉昌安带着儿子塔克世在明军围城之前冒险进入了古勒城，一来劝阿台投降明军，不行的话也要把女儿带出险地。
可是明军的向导尼堪外兰早就在觊觎建州左卫的地盘，想要着借明军的手杀害觉昌安和塔克世，以让建州左卫群龙无首，自己好趁机夺取这眼馋已久的势力范围。
于是，尼堪外兰不但唆使明军尽快攻城，还在城外大肆渲染“杀阿台者，封古勒城主”的虚假军情；古勒城内因此大乱、不能坚守，明军见状趁势展开攻城，在一片混战中，阿台兄弟及建州右卫的民众被杀二千多人，而想要劝和的觉昌安和塔克世也在此期间被明军给误杀。
事后，二十五岁的努尔哈赤得知了父祖被明军误杀，因此愤概不已，向明朝发出文书，要求明军做出解释。而辽东总兵李成梁知道此事后也觉得心中有愧，在将觉昌安和塔克世的遗体交还给努尔哈赤后，又给了他三十道敕书、三十匹马，并让努尔哈赤承袭了建州左卫指挥使的官职、再加“龙虎将军”的官阶，兼都督佥事。
凭借这个明朝所认证的官方身份，努尔哈赤正式进入创业阶段；此后，努尔哈赤用父、祖所遗下的十三副盔甲为原始资本，开始了统一建州三卫女真、乃至辽东其他女真各族的军事征服过程；三十二年后，至万历四十四年，时年五十七岁的努尔哈赤基本统一了辽东女真各部；这一年，努尔哈赤在自己的居城赫图阿拉称帝建国称汗，国号“大金”，改元“天命”，自称“覆育列国英明汗”。
后面的故事，就是努尔哈赤正式和明朝分庭抗礼、攻略争斗的过程了。
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